方济各过世后，各界关注焦点之一是梵蒂冈与中国的关系将怎么发展、是否会延续他在任时的的方向，也就是对中国释出沟通善意。

方济各对中国的立场评价褒贬两极，有人赞许他改善中梵关系，但也有声浪认为他较过去的教宗更为“亲中”，质疑他向中国政府低头妥协，而且对于中国压迫维吾尔人权、限缩香港自由等议题批判不足。

梵中之间的争议核心，围绕在主教的任命：梵蒂冈主张各国各级主教的祝圣权（consecration）或任命权在教宗手上，但中国政府拒绝，认为这么做形同失去主权。

2018年，双方签署为期2年的《主教任命临时协议》，允许梵蒂冈和北京都承认的主教被“祝圣”。该协议后来三度延长期限，但内文细节一直没有公开。香港教区荣休主教陈日君等人批评，方济各为了跟中国谈判建交，而不顾神权底线、对中国政权让步。

梵中争议也涉及政治问题。当前，梵蒂冈是欧洲唯一不承认北京是中国合法政权的国家，跟中华人民共合国并没有正式外交关系，而是与中华民国台湾建交。

北京政府尚未决定是否要与梵蒂冈建立正式关系。若天主教“地下教会”正式获得承认，对于社会稳定可能带来的冲击，仍是中国政府担忧的原因之一。

盼与习近平会晤遭中方冷处理

方济各曾多次表达访中的意愿，但任内未能实现。

2022年，方济各跟中国国家主席习近平曾同时出访哈萨克；路透社当时引述消息人士说法指，方济各有意安排与习近平见面，但中方回应“没有足够时间”。隔年，方济各造访蒙古，当时不少中国天主教徒低调前往蒙古，有教徒受访时也表示希望方济各有一天能造访中国。

去年，中国正式承认95岁的石洪祯为天津教区主教；对此，梵蒂冈 “满意”且乐见，认为“这项措施是教廷与中国政府长期沟通而带来的正面成果”。石洪祯被称为“地下主教”，他在2019年由于拒绝加入中国天主教爱国会而遭到软禁。

中国共产党秉持无神论立场，严格控制宗教活动。根据中国官方数据，约有6百万名天主教徒生活在中国，属于国家监督的 “中国天主教爱国会”一员，不承认梵蒂冈的权威。不过，中国天主教徒的实际人数，可能是这个数字的2倍；有估计指出，另有约6百万人也忠于教宗，参加“地下教会”。