好问题。虽然外交部驻外使领馆确实负责在境外签发签证，但中国签证和入境政策的制定与管理，并不是只有外交部一个部门说了算。 实际上，这是一个多部门协同工作的体系。

具体管理职责是这样划分的：

• 外交部 (及其驻外机构)：负责在境外（比如你所在的日本）受理和审批签证申请，签发签证。你提到的“给日本人免签”，就是由外交部等机构对外宣布和实施的政策之一。

• 国家移民管理局 (隶属于公安部)：这才是负责制定和执行外国人入境、停留居留等核心管理政策的部门。例如，外国人进入中国后的停留居留管理、口岸签证签发、以及你提到的免签政策的具体实施细节，都由这个部门负责。

• 驻外使领馆：它们在外交部领导下开展工作，但签证的最终审核与签发，也需遵循由国家移民管理局等部门共同拟定的法律法规。

简单来说，关于给不给签证、给哪种签证，最终由外交部和驻外使领馆根据法律法规来决定。但是，制定“给哪些国家免签”、“免签能待多久”这些大的政策框架，以及外国人入境后的管理，是由国家移民管理局（公安部）深度参与的。