中华人民共和国成立后，孙越崎历任全国政协第二、三、四届委员，民革唐山市委员会主任委员，民革河北省委员会主任委员。1979年，孙越崎曾任河北省政协副主席、河北省人大常委会副主任。1980年，孙越崎在全国政协五届三次会议上当选为全国政协第五届常委。1981年12月25日，民革中央五届二中全会增补孙越崎为第五届民革中央副主席。1983年，孙越崎当选为全国政协第六届常委，兼全国政协经济建设组组长。后来，孙越崎历任第六届民革中央副主席，第七届民革中央監察委員会主席。他是中国人民政治協商会議全国委員会第二至四届委員、第五至七届常務委員。^[1][2]

1981年，孙越崎任中华人民共和国煤炭工业部顾问。他还先后兼任中华人民共和国进出口管理委员会特邀顾问、中华人民共和国对外经济贸易部特邀顾问，其间结识了时任进出口管理委员会副主任的江泽民。此外，他还先后兼任中国统配煤矿总公司顧問、民生实业公司董事長、复旦大学北京校友会会长、欧美同学会名誉会长、辛亥革命研究会名誉理事长、焦作工学院名誉院长等职务。1984年下半年，中美国际工程公司在深圳召开成立预备会，孙越崎获聘为该公司咨询委员会名誉主任。^[1][2][12]

自文化大革命结束后的十余年间，孙越崎将大量精力不断用在为原资源委员会人员的平反上。自从资源委员会起义之后，在连续不断的政治运动中，原资源委员会各级人员普遍受到冲击、迫害，甚至折磨致死，不少人员的子女也受到牵连。这些人员及已去世人员的遗属，在文化大革命结束后，纷纷要求原资源委员会的领导人孙越崎帮助平反并落实政策。孙越崎以《晋书》中的“吾虽不杀伯仁，伯仁由我而死。幽冥之中，负此良友”自勉，痛感自己对不住原资源委员会的诸位同仁，不断向中共中央提出申诉，努力帮助大家解决问题，但仍有很多问题没有得到解决。1991年10月24日，已经98岁的孙越崎致信中共中央总书记江泽民，信中列举了资源委员会护产及起义有功的事实，要求中共中央重新审议资源委员会的“起义”性质问题。^[1][2][12]

江泽民接到孙越崎的信后，很快派中共中央统战部部长丁关根、中共中央办公厅主任温家宝到孙越崎家中了解情况并听取意见。1992年3月16日，江泽民邀请孙越崎到中南海面谈，并且共进晚餐。席间，江泽民明确肯定了资源委员会人员拒迁台湾，护厂护产的贡献，并提出资源委员会的活动带有“起义”性质，资源委员会人员中与中共地下党有接触的骨干人员，可按中共地下工作人员参加革命一样对待，待遇应高于起义人员。经江泽民提议，1992年10月7日，中共中央政治局常委宋平会见了孙越崎等原资源委员会在北京的部分人员。在会见中，宋平表示，资源委员会护产并迎接解放的行动是正义的爱国行动，是有功的，中国共产党及中国人民充分肯定孙越崎等原资源委员会负责人及工作人员的此项历史功绩。次日，新华社专门对此作了报道。1992年10月16日，孙越崎百岁（虚岁）寿辰当天，中共中央又将原资源委员会的骨干人员请到北京开会，由宋平主持，晚上在中南海安排宴会。^[1][2]

1992年10月16日，孙越崎百岁（虚岁）寿辰，江泽民派中共中央统战部部长丁关根送来江泽民和孙越崎在中南海合影的大照片，照片上有一行题词：“孙越崎老百岁寿辰留念，江泽民，一九九二年十月十六日。”同日，遵邓颖超生前遗言，有关人员送来一尊寿星，为孙越崎祝寿。民革中央、中国石油天然气总公司、中国统配煤矿总公司等单位联合开会庆祝孙越崎百岁寿辰。会上，朱学范、钱伟长、程思远等20多位知名人士倡议向海内外筹集“孙越崎科技教育基金”，作为孙越崎的百岁寿礼，以便为中国国内和煤、油、电专业有关的大学设奖学金。晚餐后，孙越崎与江泽民等人合影。^[1][2]

1992年，在民革八大会议上，孙越崎、朱学范、侯镜如被推举为民革中央名誉主席。随后，孙越崎出席了全国政协1993年1月1日举行的新年茶话会，同江泽民、李鹏等人合影。1993年3月，孙越崎委员出席了全国政协八届一次会议。1993年10月13日，全国政协主席李瑞环在中共中央统战部礼堂主持了为孙越崎举行的100周岁庆贺活动。李瑞环向孙越崎赠送了一盆梅花鹿茸，并转达了江泽民、李鹏、乔石对孙越崎的祝贺。^[1][2]同年10月，在北京召开的孙越崎科技教育基金会颁奖大会和在北京召开的复旦大学第三届世界校友联谊会（该届会议为孙越崎的生日而破例召开，原规定每两年召开一届）共同在中国社会科学院礼堂为孙越崎举行了祝寿活动，复旦大学校长杨福家参加，校友李岚清副总理参加并向孙越崎致送鲜花，孙越崎以复旦大学北京校友会会长身份讲话。^[17]