自然出版指数NPI指的是一个机构或国家在《自然》学术期刊上发表的论文数量的换算值。因为一篇论文通常会有好几个作者，而这些作者往往来自不同国家和机构，所以自然出版指数是经过了折算后的一个数值。自然出版指数是衡量一个国家基础科学实力的指标，由《自然》出版集团每隔一段时间发表。根据2013年的《自然出版指数》(NPI)排行，中国科学院2013年共有165篇论文发表在《自然》杂志及其子刊上，自然出版指数NPI为63.15，首次取代东京大学，排名亚太地区第一，全球第六。这也是中国科研机构首次晋级《自然出版指数》全球前十。除了中科院以外，中国科技大学、清华大学和北京大学等机构都获得了不少数值。中国的NPI指数也在2013年超过常年占据亚洲第一位的日本。

单看这个成绩，似乎有理由为中国科学实力的极大增强大加喝彩。

不过需要指出的是，中国的科研人员数量是130万，而日本的科研人员只有中国的一半。

中国的指数有相当大部分来自国际合作，比如华大基因和上海交通大学90%的论文就是通过国际合作得来的。整体上来说，中国的NPI有一半来自国际合作，而日本只有不到三分之一来自国际合作。这种大规模的跨国合作，当然和中国的大资金投入分不开。但是这种资金投入的回报并不高，根据世界银行的数据显示，中国 2012年在知识财产上每赚10亿美元就要付出177亿美元。

而且，即使是化学这门中国在NPI大挣分数的学科，在中国排前三位的中科院，中国科技大学和厦门大学这三所机构在2013年共发表了38篇文章，但是其中33篇是发表在《自然》的网络论坛上的。而发表在纸质印刷的更有威望的《自然》期刊的论文数量最多的是两所日本的大学。实际上，中国科学院有一半的分数是通过发表在《自然》的网络论坛的论文取得的。

如果不和日本比，而和美国与英国比，你就发现情况更加不乐观了。

美国2013年的NPI指数不止十倍于中国!而常年居于NPI第二位的，人口数量和国土面积只有中国一个省规模的英国2013年的NPI指数大概是中国的两倍。